从根本、源头上清理整顿。比喻澈底改革以解决问题。语本《汉书・卷二三・刑法志》。△“拔本塞源”
今汉承衰周暴秦极敝之流，俗已薄于三代，而行尧舜之刑，是犹以鞿而御𫘣突，违救时之宜矣。且除肉刑者，本欲以全民也，今去髡钳一等，转而入于大辟。以死罔民，失本惠矣。故死者岁以万数，刑重之所致也。……岂宜惟思所以清原正本之论，删定律令，籑二百章，以应[1]。其余罪次，于古当生，今触死者，皆可募行肉刑。及伤人与盗，吏受赇枉法，男女淫乱，皆复古刑，为三千章。诋欺文致微细之法，悉蠲除。如此，则刑可畏而禁易避，吏不专杀，法无二门，轻重当罪，民命得全，合刑罚之中，殷天人之和，顺稽古之制，成时雍之化。
[1]大辟：死刑。
“正本清源”原作“清原正本”。汉代的史学家班固，曾在《汉书》的〈刑法志〉中讨论国家的刑法制度，认为当时的法律有许多不合宜的地方，处刑的轻重常拿捏不当，重者太重，死刑人数过多；轻者太轻，无法达到遏止的效果。在这种情况之下，无法遏止轻犯者作恶，官吏又每每以斩大盗建立威信，结果社会依然混乱。原因除了礼乐教养的缺乏外，就是刑法制定不当的后果。所以班固认为必须要从源头开始清理、从根本开始整顿，也就是从检讨刑法制度做起，修改不当的法令，重新衡量罚则的轻重，才能使社会达到真正的安定，人民有安乐的生活。后来“正本清源”这句成语就从这里演变而出，比喻澈底改革以解决问题。出现“正本清源”的书证如《晋书・卷三・武帝纪》：“思与天下式明王度，正本清源，于置胤树嫡，非所先务。”
语义比喻澈底改革以解决问题。
类别用在“澈底解决”的表述上。
①人人养成守法观念，才是正本清源，维护社会治安的好方法。
②我们必须在思想上正本清源，才能去除一些不正确的价值判断。
③如今社会风气败坏，想要移风易俗，唯有正本清源，从心灵改革著手。
④如果要完全消弭工程绑标的弊端，就必须正本清源地从制度面下手才行。
⑤想要助他步上正途，唯有断绝他跟不良朋友的往来，才是正本清源的好方法。
⑥公司内部弊病丛生，他虽想要正本清源地加以改革，却无法克服来自各方面的许多阻挠。
1，我们必须在思想上正本清源，才能去除一些不正确的价值判断。
2，房价问题需要正本清源，住房问题现在是民生问题的一个重要热点，而畸高房价成为大众诟病的焦点。
3，21 绿色建筑需要正本清源。
4，民国的洪宪宗洪秀全领导的太平天国运动，始终追求着正本清源的目标，但最终由于多种原因未能实现。
5，介绍上海市名医郑平东教授论治慢性肾炎蛋白尿固精止涩、正本清源，以及补本善后的临证经验。
6，广种博收善学习，兼顾各方重大局；正本清源强素质，文思武进增本领。
7，人人养成守法观念，才是正本清源，维护社会治安的好方法。
8，10 正本清源，正，使之正，引申为整顿；本，树根，引申为根本；正本：从根本上整顿；源，水源，源头；清源：从源头上清理。从根本上整顿，从源头上清理。
9，教育的根本任务就是培养学生的正直品质，教会他们正本清源的道理，使他们成为具有责任和担当的社会人。
10，42 这种发展态势,既不利于媒体发挥应有的监督作用,也不利于白酒业正本清源,更让公众无从判明是非。